陶瓷膜在過濾過程中可以采用一定的措施預防和控制膜污染進程，但是膜的污染是無法完全避免的。隨著運行時間的延長，陶瓷膜的滲透通量降低很快，此時達不到工業設計需求，而且污染物質長期附在膜面和存在于孔內可能與膜發生化學作用而減少其使用壽命，所以為了盡可能的恢復膜的性能參數，且使恢復的各項性能參數隨時間遞增的衰減性變小，延長膜的使用壽命，減少換膜的費用，必須定期對陶瓷膜進行清洗。膜的清洗可以分為物理清洗和化學清洗。
物理清洗：
物理方法主要是機械清洗，包括清水漂洗、反沖、氣液脈沖沖洗和刮除、超聲震動等；物理清洗方法具有不引入新污染物、清洗步驟簡單，可以在線清洗等特點，但該法僅對污染初期的膜有效，清洗效果隨著時間的延長迅速降低。化學清洗是在水中加入特定的化學藥劑，連續循環清洗，該法能清除復合沉積污垢，快速的恢復膜通量。物理清洗沒有明確的針對性，一般能去除多種污染物質,但清除不夠徹底。
化學清洗：
化學方法是利用化學試劑來去除膜面沉淀物和污垢，常用的化學清洗劑有酸、堿、氧化劑以及螯合劑等。化學清洗存在向膜系統引入新的污染物的可能性，也不能排除污染物質與膜之間發生化學作用的可能性，且運行與清洗之間的轉換步驟較多，必須離線清洗。不同污染體系差別很大，沒有任何一種清洗劑可以對什么污染物質都有效，因此，必須依據膜面污染物是物化性質來對清洗方法和清洗劑進行合理選擇和區分不同污垢有的放矢地進行清洗。
化學清洗技術針對性較強,它對特定的污染物質有較強的分解作用,能較徹底地對陶瓷膜進行清洗, 如果選對清洗劑效果就不好，故使用化學清洗前能確定對污染物質類型,以便選擇適宜的化學清洗劑。
陶瓷膜具有優異的化學穩定性和很高的機械強度，可采用比有機膜。更廣泛的清洗方法進行清洗。目前陶瓷膜化學清洗的一般規律為:無機強酸使污染物中一部分不溶性物質變為可溶性物質;有機酸主要清除無機鹽的沉積，鰲合劑可與污染物中的無機離子絡合生成溶解大的物質，減少膜表面和孔內沉積的鹽和吸附的無機污染物;表面活性劑主要清除有機污染物;強氧化劑和強堿是清除油脂和蛋白、藻類等生物物質的污染。對于污染非常嚴重的膜，通常采用強酸、強堿交替清洗，并加入次氯酸鈉等氧化劑與表面活性劑。在這些清洗過程中，常采用高速低壓的操作條件，有時配以反沖，以發揮物理方法的作用，程度恢復膜通量。